Sólo dos composiciones suyas sobreviven, las dos impresas en antologías de música de iglesia: una en "Siren coelestis", 2-4 voces (Munich, 1616), la otra en "Promptuarii musici" de Johann Donfrid (Estrasburgo, 1622).
La última recopilación contiene principalmente música italiana, y la presencia de Mayr entre los pocos alemanes representados puede haber sido resultado de su habilidad de escribir en un estilo italianizado.
Ciertamente su motete del Día de la Purificación "Hodie beata virgo", para dos sopranos y continuo, muestra una completa asimilación al estilo del dúo italiano post-Viadana: aunque no melodioso es agradablemente canónico, y Mayr era ocasionalmente consciente de las posibilidades de la disonancia.
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